Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QRK9 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms