Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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