Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms