Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM6SF1Q9BZW5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms