Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM64DP-201ENST00000529289 1342 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007161.2-201ENST00000604734 1109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031601.2-201ENST00000622823 457 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356585.3-201ENST00000625196 1017 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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