Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGOH3P-201ENST00000605130 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV2-70-201ENST00000617374 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244093.5-201ENST00000619606 718 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00032-201ENST00000638495 1040 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM49A-202ENST00000406434 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL662907.3-201ENST00000641271 1932 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY1A1-201ENST00000303902 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY1D-203ENST00000418956 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY1B-203ENST00000619219 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATG4A-202ENST00000345734 2129 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001107.1-201ENST00000501708 2792 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01511-202ENST00000504989 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHA6-209ENST00000514100 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPG21-209ENST00000559199 2059 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLEC4C-202ENST00000360345 970 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms