Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms