Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SSBP4Q9BWG4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms