Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PADI4-201ENST00000375448 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms