Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GBGT1Q8N5D6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms