Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.2 ms