Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STRADAQ7RTN6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms