Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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