Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms