Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms