Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms