Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FXNQ16595 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FXNQ16595 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FXNQ16595 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FXNQ16595 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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