Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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