Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ITGA9Q13797 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ITGA9Q13797 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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