Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms