Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms