Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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