Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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