Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EP300Q09472 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EP300Q09472 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
EP300Q09472 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms