Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RELBQ01201 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RELBQ01201 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RELBQ01201 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RELBQ01201 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms