Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms