Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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