Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms