Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL23P55773 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL23P55773 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms