Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HCCSP53701 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HCCSP53701 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HCCSP53701 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HCCSP53701 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms