Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms