Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBP50607 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBP50607 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms