Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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