Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRMP28827 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms