Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN1P18031 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms