Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRRT4C9JH25 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms