Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP1Q9UPQ3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms