Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNMA3Q9UL41 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms