Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms