Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms