Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXP3Q9BZS1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXP3Q9BZS1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms