Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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