Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA3Q96KX2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms