Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTF1AQ7RTS3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms