Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DENND5BQ6ZUT9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms