Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A1Q6PCB7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms