Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms