Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms