Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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