Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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STRN3Q13033 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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STRN3Q13033 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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STRN3Q13033 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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